More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1584 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
300 aa  568  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  61.46 
 
 
315 aa  319  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  59.12 
 
 
318 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  62.2 
 
 
317 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  62.64 
 
 
375 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  56.31 
 
 
305 aa  304  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  58.62 
 
 
316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  63.14 
 
 
322 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  55.74 
 
 
344 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  61.15 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  60.27 
 
 
317 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  62.37 
 
 
294 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  54.15 
 
 
330 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  64.44 
 
 
328 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  59.8 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  60.61 
 
 
317 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  55.86 
 
 
320 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  51.32 
 
 
332 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  51.19 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  54.42 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  55.05 
 
 
341 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  52.2 
 
 
333 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  56.9 
 
 
318 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  56.9 
 
 
318 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  56.9 
 
 
318 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  49.69 
 
 
341 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  52.16 
 
 
346 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 
355 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  43.65 
 
 
370 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  46.45 
 
 
361 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  47.57 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  51.02 
 
 
327 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  44.27 
 
 
372 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  42.06 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  41.54 
 
 
339 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  42.17 
 
 
324 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  41.37 
 
 
328 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  46.4 
 
 
323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  43.87 
 
 
335 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
327 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  39.22 
 
 
329 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  43.81 
 
 
327 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  39.3 
 
 
343 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  40.07 
 
 
344 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.96 
 
 
334 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.52 
 
 
323 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  29.19 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.11 
 
 
323 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 
321 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.25 
 
 
334 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  32.9 
 
 
332 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  34.08 
 
 
344 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  27.52 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  38.65 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  36.26 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.35 
 
 
337 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  34.57 
 
 
346 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  34.75 
 
 
331 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  30.53 
 
 
341 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.99 
 
 
340 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.43 
 
 
333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  36.58 
 
 
332 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.97 
 
 
329 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.97 
 
 
329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.26 
 
 
325 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  33.44 
 
 
344 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  34.64 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  35.16 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  37.4 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  37.4 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  37.4 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  37.4 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  37.7 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.26 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  37.7 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  37.7 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.26 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  37.4 
 
 
325 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  37.88 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  32.78 
 
 
318 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  37.06 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  35.83 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.99 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  37.16 
 
 
323 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.23 
 
 
372 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.97 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  28.09 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.63 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  34.08 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  35.16 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.04 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  37.3 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  37.73 
 
 
322 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  36.92 
 
 
324 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>