More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  100 
 
 
332 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  59.59 
 
 
341 aa  311  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  60.18 
 
 
327 aa  285  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  59.4 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  57.19 
 
 
314 aa  278  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  50.15 
 
 
344 aa  268  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  50.78 
 
 
318 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  48.43 
 
 
355 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  50.47 
 
 
315 aa  255  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  52.69 
 
 
341 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  50.63 
 
 
317 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  47.96 
 
 
316 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  49.4 
 
 
375 aa  242  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  48.15 
 
 
330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  50.66 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  48.47 
 
 
329 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  46.08 
 
 
305 aa  222  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  52.38 
 
 
335 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  51.32 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  48.46 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  50.15 
 
 
317 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  48.61 
 
 
341 aa  205  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  47.37 
 
 
322 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  48.48 
 
 
327 aa  203  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  47.12 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  43.55 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  52 
 
 
328 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  50.77 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  45.15 
 
 
372 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  50.84 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  43.55 
 
 
361 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  50.17 
 
 
318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  50.17 
 
 
318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  50.17 
 
 
318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  44.27 
 
 
321 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.86 
 
 
339 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  34.69 
 
 
344 aa  159  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  34.63 
 
 
343 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.43 
 
 
334 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  32.56 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  38.46 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.51 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  34.54 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  34.75 
 
 
323 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  29.25 
 
 
320 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 
323 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  34.75 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  31.55 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  34.75 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  34.75 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.17 
 
 
319 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.92 
 
 
340 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.53 
 
 
315 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  28.1 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  36.17 
 
 
317 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.64 
 
 
323 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  36.5 
 
 
333 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.56 
 
 
327 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 
323 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.5 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  32.33 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  34.93 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  38.33 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  38.96 
 
 
314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 
318 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  36.68 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.81 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.73 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.4 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.42 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.73 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  29.69 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.73 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  31.21 
 
 
336 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.29 
 
 
318 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.96 
 
 
337 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.53 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.23 
 
 
329 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.03 
 
 
324 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.78 
 
 
344 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.53 
 
 
329 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  33.73 
 
 
328 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.4 
 
 
355 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 
325 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 
319 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 
335 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  34.03 
 
 
344 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  31.76 
 
 
326 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  34.6 
 
 
321 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 
325 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  34.63 
 
 
339 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08710  thiamine-monophosphate kinase  34.55 
 
 
382 aa  123  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.827789  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 
318 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>