More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8005 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  100 
 
 
318 aa  614  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  74.4 
 
 
294 aa  345  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  57.14 
 
 
315 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  54.2 
 
 
375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  57.88 
 
 
317 aa  315  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  56.27 
 
 
330 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  55.05 
 
 
344 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  60.12 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  59.12 
 
 
300 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  55.56 
 
 
305 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  51.94 
 
 
316 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  57.65 
 
 
317 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  55.45 
 
 
322 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  56.27 
 
 
321 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  58.63 
 
 
317 aa  268  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  50.78 
 
 
332 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  48.98 
 
 
341 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  51.53 
 
 
346 aa  245  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  55.26 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  48.43 
 
 
314 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  45.59 
 
 
355 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  50.79 
 
 
322 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  50.96 
 
 
320 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 
333 aa  229  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  47.92 
 
 
341 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  48.9 
 
 
341 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  51.57 
 
 
327 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  51.91 
 
 
318 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  51.91 
 
 
318 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  51.91 
 
 
318 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  42.14 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  41.72 
 
 
323 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  58.01 
 
 
370 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  47.59 
 
 
335 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  44.38 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.21 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  42.33 
 
 
372 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  39.44 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  38.38 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 
329 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.09 
 
 
328 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.81 
 
 
323 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.7 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34.43 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 
323 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  29.38 
 
 
314 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  35.8 
 
 
338 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.63 
 
 
350 aa  156  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.99 
 
 
346 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.42 
 
 
333 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  38.81 
 
 
337 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  37.99 
 
 
326 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.63 
 
 
329 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  37.99 
 
 
326 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  37.99 
 
 
326 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 
337 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30.09 
 
 
344 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 
336 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  37.69 
 
 
326 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  36.47 
 
 
340 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  32.25 
 
 
336 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 
315 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 
324 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  36.64 
 
 
325 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  36.06 
 
 
323 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  36.93 
 
 
332 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  36.67 
 
 
325 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  35.38 
 
 
329 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  36.67 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  36.67 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  35.38 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  35.38 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  38.72 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  36.67 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  36.67 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  36.67 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  36.67 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  36.86 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.22 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 
355 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  31.75 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.65 
 
 
326 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.25 
 
 
326 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 
320 aa  145  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  35.92 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.47 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 
355 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  34.86 
 
 
344 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  35.21 
 
 
344 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.36 
 
 
346 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  37.77 
 
 
317 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  36.08 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.76 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  36.2 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.25 
 
 
319 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
318 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.04 
 
 
333 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>