More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1165 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
317 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  89.27 
 
 
317 aa  494  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  66.88 
 
 
317 aa  391  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  58.63 
 
 
318 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  59.02 
 
 
316 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  57.49 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  59.47 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  58.7 
 
 
315 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  55.46 
 
 
375 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  60.61 
 
 
300 aa  308  9e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  61.24 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  58.44 
 
 
322 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  54.32 
 
 
330 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  56.56 
 
 
329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  61.72 
 
 
328 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  59.52 
 
 
294 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  51.78 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  50.77 
 
 
332 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  50.3 
 
 
341 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  52.7 
 
 
322 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  53.05 
 
 
314 aa  245  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  46.73 
 
 
355 aa  242  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  51.09 
 
 
346 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  47.91 
 
 
333 aa  225  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  48.56 
 
 
341 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  51.13 
 
 
318 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  51.13 
 
 
318 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  51.13 
 
 
318 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  45 
 
 
341 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  51.58 
 
 
327 aa  208  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  58.86 
 
 
370 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  43.38 
 
 
372 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  35.42 
 
 
334 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  39.21 
 
 
339 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  43.18 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  43.73 
 
 
327 aa  178  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  47.58 
 
 
335 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.35 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.62 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.42 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  37.85 
 
 
344 aa  162  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.89 
 
 
328 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  39.33 
 
 
323 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
343 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.65 
 
 
334 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  38.08 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 
329 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  34.48 
 
 
358 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 
355 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  36.69 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.2 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  31.44 
 
 
355 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.03 
 
 
344 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 
354 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.98 
 
 
346 aa  145  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.44 
 
 
323 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.85 
 
 
337 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  27.62 
 
 
314 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.35 
 
 
333 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.53 
 
 
315 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  42.09 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.81 
 
 
363 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 
323 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  32.29 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35.16 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.84 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  38.19 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  38.32 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  37 
 
 
319 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
320 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
320 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.21 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  36.92 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  37.86 
 
 
325 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  38.96 
 
 
322 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  39.22 
 
 
317 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  36.59 
 
 
319 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.76 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.94 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  36.88 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  34.3 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 
369 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.54 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 
352 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  39.16 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  29.21 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>