More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0204 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 330 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  66.77 
 
 		 329 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  56.27 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  56.13 
 
 		 315 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  54.57 
 
 		 317 aa  308  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  52.98 
 
 		 344 aa  295  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  49.72 
 
 		 375 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  54.82 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  51.67 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  51.68 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  48.02 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  48.39 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  50.3 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  48.15 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  52.01 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  47.17 
 
 		 305 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  46.48 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  51.05 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  55.13 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  47.48 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  54.32 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  42.98 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  54.05 
 
 		 328 aa  225  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  49.1 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  48.32 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  47.46 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  50.85 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  50.85 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  50.85 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  60.34 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  46.31 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  41.81 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  40.75 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  40.24 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  39.83 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  38.06 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  41.19 
 
 		 372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.53 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.53 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  35.06 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.58 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.44 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  39.65 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.69 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  34.5 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.22 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.86 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  34.72 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  31.42 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  37.18 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  34.02 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.7 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  32.83 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  35.25 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  33.84 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.42 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.38 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  28.76 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.41 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  40.38 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.97 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  29.64 
 
 		 355 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  28.31 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  37.19 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  34.58 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 		 363 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  28.72 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  31.31 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  43.81 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  37.32 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  31.33 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  33.84 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  32.84 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  30.23 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  31.59 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  45.65 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.2 
 
 		 321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  36.67 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.28 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  32.38 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.28 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  35.28 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.28 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  29.91 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.28 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  37.19 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.28 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>