More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2789 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
294 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  74.4 
 
 
318 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  58.57 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  61.62 
 
 
315 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  62.29 
 
 
300 aa  315  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  60 
 
 
344 aa  311  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  62.21 
 
 
329 aa  291  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  58.7 
 
 
317 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  54.79 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  56.31 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  55.1 
 
 
316 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  59.32 
 
 
317 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  59.66 
 
 
322 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  53.16 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  60.98 
 
 
328 aa  245  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  55.97 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  51.27 
 
 
341 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  47.63 
 
 
355 aa  238  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  59.52 
 
 
317 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  50.51 
 
 
314 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  54.49 
 
 
346 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  53.02 
 
 
341 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  51.85 
 
 
320 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  53.67 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  50.85 
 
 
333 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  53.7 
 
 
322 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  46.73 
 
 
341 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  47.45 
 
 
361 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  53.82 
 
 
318 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  53.82 
 
 
318 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  53.82 
 
 
318 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  47.85 
 
 
327 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  45.66 
 
 
372 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  43.51 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  61.04 
 
 
370 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  46.56 
 
 
335 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  39.41 
 
 
329 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.96 
 
 
339 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  40.36 
 
 
343 aa  165  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  36.25 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.03 
 
 
323 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
327 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  31.8 
 
 
315 aa  158  9e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 
358 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.43 
 
 
334 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.6 
 
 
329 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.6 
 
 
329 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  35.39 
 
 
336 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.27 
 
 
329 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  37.3 
 
 
340 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  36.13 
 
 
336 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 
344 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  35.5 
 
 
328 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  38.85 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  29.29 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  34.19 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  33.13 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  32.5 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  34.84 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  38.52 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.74 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.06 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  34.74 
 
 
332 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 
355 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  36.63 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  37.06 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  36.57 
 
 
331 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  35.97 
 
 
344 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  33.88 
 
 
320 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  33.88 
 
 
320 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
319 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  30.39 
 
 
314 aa  144  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  38.95 
 
 
372 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  37.26 
 
 
338 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  39.84 
 
 
329 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  37.25 
 
 
325 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  34.09 
 
 
336 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  38.82 
 
 
322 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
344 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.27 
 
 
326 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  37.25 
 
 
325 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  37.25 
 
 
325 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  37.25 
 
 
325 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 
315 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  37.25 
 
 
325 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  37.25 
 
 
325 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 
355 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  37.25 
 
 
325 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  37.25 
 
 
325 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.95 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  33.65 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  37.42 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  33.8 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  38.31 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  38.31 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.97 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  31.07 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  38.31 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.76 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>