More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1932 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
318 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
318 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
318 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  72.9 
 
 
333 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  69.25 
 
 
322 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  68.44 
 
 
320 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  57.39 
 
 
300 aa  258  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  50.17 
 
 
305 aa  251  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  52.79 
 
 
375 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  51.91 
 
 
318 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  52.56 
 
 
322 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  48.57 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  51.6 
 
 
321 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  49.21 
 
 
317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 
344 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  51.35 
 
 
330 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  51.3 
 
 
317 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  51.41 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  50.51 
 
 
332 aa  218  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  49.32 
 
 
314 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  50.62 
 
 
329 aa  208  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  48.37 
 
 
346 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  46.08 
 
 
361 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  50.8 
 
 
317 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  51.63 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  51.25 
 
 
294 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  42.53 
 
 
355 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  47.6 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  43.85 
 
 
372 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  44.88 
 
 
341 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.69 
 
 
323 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 
327 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.1 
 
 
324 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.52 
 
 
334 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  40.15 
 
 
328 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  41.79 
 
 
323 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  43.03 
 
 
327 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  50.27 
 
 
370 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  36.33 
 
 
331 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.25 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.13 
 
 
350 aa  140  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  38.49 
 
 
329 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.2 
 
 
333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  43.27 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  40.34 
 
 
314 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  37.28 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  34.51 
 
 
344 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  36.23 
 
 
323 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  33.76 
 
 
343 aa  125  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.02 
 
 
329 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 
337 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  37.91 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  36.65 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  33.64 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.46 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  37.66 
 
 
322 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
335 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.7 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  37.66 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.07 
 
 
327 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  36.72 
 
 
319 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  29.87 
 
 
355 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 
333 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 
333 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  35.97 
 
 
321 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 
333 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 
333 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 
333 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 
333 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 
333 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.01 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.01 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  35.46 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  37.86 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  36.17 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.2 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  35.06 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.66 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  36.3 
 
 
325 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  38.85 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.2 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.2 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.22 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  34.42 
 
 
354 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.22 
 
 
318 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>