More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3206 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 361 aa  685    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  45.7 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  41.28 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  43.62 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  43.29 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  42.69 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  46.45 
 
 		 300 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  41.98 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  42.94 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  41.64 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  41.42 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  45.45 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  38.89 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  43.55 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  42.73 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  42.8 
 
 		 323 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  42.91 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  44.31 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  43.55 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  44.31 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  44.31 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  46.73 
 
 		 328 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  41.76 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  38.64 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  47.45 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  38.27 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  40.51 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  39.48 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  35.36 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  39.12 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  39.5 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  45.02 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  34.1 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  42.86 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.06 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  34.89 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  36.18 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.31 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.29 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  27.38 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  34.8 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.6 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  27.36 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.48 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  42.94 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  29.64 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  31.87 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.54 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  29.74 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  31.48 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.2 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30.95 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  32.99 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  32.05 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  31.32 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  28.39 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.95 
 
 		 539 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  34.1 
 
 		 321 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  28.91 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  39.04 
 
 		 314 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  29.59 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  24.73 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  29.04 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  33.82 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  38.66 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  26.96 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.86 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  31.47 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  27.66 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 		 329 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.82 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00281  putative thiamine-monophosphate kinase  31.03 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  32.05 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  29.36 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  30.9 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.43 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  27.07 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  33.1 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  32.34 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  27.47 
 
 		 332 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  28.86 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  31.74 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  31.13 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  31.74 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  30.66 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  26.37 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  29.64 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  28.15 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  30.66 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>