More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0332 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
354 aa  726    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  68.08 
 
 
355 aa  518  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  61.58 
 
 
363 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  60.62 
 
 
355 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  60.06 
 
 
355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  58.64 
 
 
354 aa  441  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  56.98 
 
 
369 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  43.91 
 
 
358 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  42.86 
 
 
346 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  41.26 
 
 
348 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  44.68 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  43.37 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  43.87 
 
 
344 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  44.62 
 
 
340 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  42.73 
 
 
339 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  40.46 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  42.44 
 
 
346 aa  238  9e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  40.96 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  37.33 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  38.44 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.4 
 
 
327 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  37.68 
 
 
328 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 
334 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.03 
 
 
323 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.83 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.14 
 
 
324 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.88 
 
 
331 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  37.11 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.8 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  37.73 
 
 
333 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.5 
 
 
318 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 
329 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  35.55 
 
 
306 aa  176  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  35.89 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  33.99 
 
 
344 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 
336 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 
332 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 
329 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  35.39 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  33.99 
 
 
344 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 
323 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.9 
 
 
346 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.16 
 
 
315 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  32.53 
 
 
341 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 
323 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  32.21 
 
 
340 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  33.81 
 
 
324 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  33.52 
 
 
326 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
313 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.61 
 
 
323 aa  149  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  35.82 
 
 
321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  34.04 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  30.25 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  36.72 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  32.63 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  31.15 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  34.57 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.45 
 
 
320 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32.11 
 
 
335 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  33.99 
 
 
326 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  34.05 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
329 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  33.53 
 
 
322 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  33.81 
 
 
326 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.97 
 
 
327 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 
318 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  34.19 
 
 
333 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  32.31 
 
 
315 aa  143  5e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
325 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.81 
 
 
319 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  34.09 
 
 
321 aa  142  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  31.53 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.71 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.87 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  32.51 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  34.17 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
323 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 
326 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.46 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.46 
 
 
318 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 
318 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  31.55 
 
 
323 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
323 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.53 
 
 
320 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.53 
 
 
320 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.46 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  32.33 
 
 
335 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  31.21 
 
 
336 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  30.43 
 
 
319 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  29.34 
 
 
332 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>