More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1035 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  100 
 
 
340 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  55.21 
 
 
331 aa  363  3e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  48.79 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  45.33 
 
 
286 aa  215  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  42.61 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  43.1 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  46.03 
 
 
286 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  42.36 
 
 
288 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 
358 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.94 
 
 
334 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  36.18 
 
 
329 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.25 
 
 
337 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  39.67 
 
 
288 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  39.64 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  34.49 
 
 
332 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 
323 aa  149  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  33.45 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  30.75 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  30.75 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  31.96 
 
 
339 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 
363 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  34.7 
 
 
341 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  36.08 
 
 
297 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.86 
 
 
346 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.55 
 
 
315 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  33.44 
 
 
322 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  31.65 
 
 
354 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  38.85 
 
 
295 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  34.09 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
336 aa  139  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  31.98 
 
 
337 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  33.55 
 
 
319 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 
355 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  33.66 
 
 
322 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  35.76 
 
 
315 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  32.24 
 
 
317 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  31.96 
 
 
355 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  34.42 
 
 
336 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  34.09 
 
 
346 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
322 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  32.36 
 
 
334 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  34.03 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  36.86 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  31.95 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  32.52 
 
 
352 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  34.03 
 
 
344 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.99 
 
 
318 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  32.68 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  33.12 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  33.58 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  32.96 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  31.8 
 
 
321 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  33.76 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  31.86 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  36.2 
 
 
307 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.61 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  33.76 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  31.35 
 
 
322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  32.44 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  32.88 
 
 
328 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.01 
 
 
355 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.11 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  29.39 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  30.38 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  28.12 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.66 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.34 
 
 
348 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  37.08 
 
 
314 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.72 
 
 
350 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  36.92 
 
 
320 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  32.42 
 
 
314 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  30.32 
 
 
327 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  32.8 
 
 
315 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  33.96 
 
 
320 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  29.57 
 
 
340 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  29.72 
 
 
321 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  29.53 
 
 
339 aa  123  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  31.98 
 
 
319 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  32.79 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.18 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  32.18 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  34.94 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  29.9 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  30.98 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  30.98 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  32.79 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  29.9 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  29.9 
 
 
326 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  31.27 
 
 
319 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  29.9 
 
 
326 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  33.47 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  32.15 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  30.19 
 
 
339 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  29.38 
 
 
335 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>