More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2319 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
286 aa  583  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  61.89 
 
 
288 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  61.67 
 
 
291 aa  351  7e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  51.57 
 
 
286 aa  287  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  49.65 
 
 
286 aa  276  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  45.33 
 
 
340 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 
331 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  42.67 
 
 
325 aa  202  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  37 
 
 
292 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  39.6 
 
 
288 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  37.74 
 
 
307 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  37.14 
 
 
295 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.63 
 
 
323 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  32.66 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  30.86 
 
 
332 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.07 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  30.72 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.38 
 
 
329 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  29.94 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 
320 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 
325 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  29.47 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  34.12 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  32.41 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  32.41 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.43 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.9 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  36.21 
 
 
314 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  30.72 
 
 
358 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  30.86 
 
 
341 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  33.09 
 
 
331 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  32.03 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  31.48 
 
 
325 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  31.48 
 
 
325 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  31.48 
 
 
325 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  31.48 
 
 
325 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.05 
 
 
337 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  31.48 
 
 
325 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 
325 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  31.48 
 
 
325 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  31.48 
 
 
325 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  34.44 
 
 
334 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  29.35 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  35.34 
 
 
305 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  31.48 
 
 
325 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  33.69 
 
 
315 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 
324 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.69 
 
 
318 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  33.47 
 
 
326 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  33.45 
 
 
332 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  31.05 
 
 
325 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.15 
 
 
336 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  33.47 
 
 
326 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
315 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 
319 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  29.15 
 
 
336 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
336 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  31.93 
 
 
315 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
317 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  32.07 
 
 
316 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  31.67 
 
 
337 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  29.31 
 
 
318 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.22 
 
 
315 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.76 
 
 
329 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  31.17 
 
 
326 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  28.33 
 
 
333 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 
329 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  27.24 
 
 
310 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  31.17 
 
 
326 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30.25 
 
 
344 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  31.17 
 
 
326 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  31.17 
 
 
326 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  30.61 
 
 
320 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 
329 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  34.96 
 
 
333 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 
323 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  34.96 
 
 
333 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  27.27 
 
 
302 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  34.96 
 
 
333 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  27.39 
 
 
306 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  34.96 
 
 
333 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  34.96 
 
 
333 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  34.96 
 
 
333 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  33.74 
 
 
332 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  34.16 
 
 
332 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  33.74 
 
 
332 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  34.96 
 
 
333 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
314 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  28.86 
 
 
321 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  32.71 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  30.33 
 
 
323 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  33.74 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  28.97 
 
 
318 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>