More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1979 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
292 aa  570  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  69.2 
 
 
288 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  67.32 
 
 
307 aa  333  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  69.31 
 
 
295 aa  328  6e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  62.63 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  42.67 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  41.95 
 
 
288 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  43.05 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  38.33 
 
 
286 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  41.78 
 
 
286 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  39.64 
 
 
340 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  38.49 
 
 
331 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  39.6 
 
 
291 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  39.86 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 
315 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  32.65 
 
 
320 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  34.24 
 
 
320 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  28.84 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  38.57 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  29.79 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  29.45 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  35.11 
 
 
304 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.45 
 
 
318 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  33 
 
 
325 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  33 
 
 
325 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  33 
 
 
325 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  33 
 
 
325 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 
315 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30.03 
 
 
333 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.48 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  32.66 
 
 
325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  32.66 
 
 
325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  33 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.89 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.89 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.89 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  32.66 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  29.79 
 
 
323 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  31.4 
 
 
336 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  33.56 
 
 
317 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  28.96 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  29.79 
 
 
323 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  36.43 
 
 
329 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  29.11 
 
 
318 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  30.03 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.94 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  30.72 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  30.95 
 
 
324 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  29.11 
 
 
319 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
334 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  38.04 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  39.42 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  30.61 
 
 
321 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.66 
 
 
324 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 
337 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  30.66 
 
 
321 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  32.59 
 
 
352 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  32.38 
 
 
323 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
315 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.39 
 
 
329 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  32.56 
 
 
323 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.32 
 
 
323 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  29.59 
 
 
325 aa  105  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.39 
 
 
329 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  37.33 
 
 
332 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
316 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  31.55 
 
 
358 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.02 
 
 
329 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  35.82 
 
 
322 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  33.58 
 
 
344 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 
334 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  31.97 
 
 
325 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  32.3 
 
 
321 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
319 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  38.08 
 
 
330 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  28.81 
 
 
318 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  34.72 
 
 
355 aa  102  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  35.4 
 
 
315 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  28.47 
 
 
322 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  33.99 
 
 
325 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.54 
 
 
327 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  27.04 
 
 
310 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  31 
 
 
302 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  32.65 
 
 
321 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.4 
 
 
329 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  30.87 
 
 
334 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
306 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  31.97 
 
 
317 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  30.91 
 
 
372 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  30.31 
 
 
321 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  34.81 
 
 
322 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 
343 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>