More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0436 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  51.57 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  51.22 
 
 		 288 aa  286  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  51.39 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  49.13 
 
 		 286 aa  267  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  42.61 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  41.36 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  40.92 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  38.33 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  37.27 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.56 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  35.02 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 		 323 aa  118  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  33.68 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  33.68 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.64 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.69 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  30.13 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  32.64 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.8 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  32.26 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  30.26 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30.26 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  30.79 
 
 		 329 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  28.05 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  32.86 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.63 
 
 		 337 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.72 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  32.88 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  32.88 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.61 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  32.76 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  29.67 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  32.53 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  30.54 
 
 		 365 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  34.55 
 
 		 344 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  31.1 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  32.11 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  27.42 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  27.59 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  25.75 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.6 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  32.07 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  33.56 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.77 
 
 		 343 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 323 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  33.73 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.06 
 
 		 344 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 		 329 aa  92.4  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  29.97 
 
 		 320 aa  92.4  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  32.98 
 
 		 326 aa  92.4  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  36.21 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  32.84 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  36.62 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 		 346 aa  92.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  28.66 
 
 		 355 aa  92  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.94 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  28.19 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.88 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  28.52 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  29.15 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  26.82 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  29.15 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  29.15 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  29.74 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  29.15 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  30.65 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  29.15 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  29.15 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  29.15 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  33.46 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  29.1 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0692  thiamine-monophosphate kinase  32.92 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  29.15 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  30.25 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  29.57 
 
 		 326 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  29.83 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  28.81 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  32.1 
 
 		 322 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  29.68 
 
 		 358 aa  89  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  26.91 
 
 		 344 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  31.78 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  29.57 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>