More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1456 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
302 aa  610  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  32.9 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 
327 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  27.86 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.62 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  30.71 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.72 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  30.71 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  30.39 
 
 
340 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.21 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  29.09 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  30.53 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  28.15 
 
 
336 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  28.9 
 
 
306 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.02 
 
 
324 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  29.67 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  30.92 
 
 
326 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  27.15 
 
 
331 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  28.96 
 
 
288 aa  105  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  30.52 
 
 
326 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  30.52 
 
 
326 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
339 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  30.52 
 
 
326 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  31.79 
 
 
315 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  29.69 
 
 
334 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  28.27 
 
 
331 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 
336 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  28.79 
 
 
329 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  30.11 
 
 
328 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  29.21 
 
 
323 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  27.76 
 
 
325 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  28.68 
 
 
335 aa  102  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  28.91 
 
 
309 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  28.9 
 
 
319 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  29.08 
 
 
325 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  29.72 
 
 
325 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  30.07 
 
 
338 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 
325 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  27.27 
 
 
286 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
315 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  28.42 
 
 
333 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  29.5 
 
 
318 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  29.8 
 
 
332 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  30.2 
 
 
332 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  30.2 
 
 
332 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  30.28 
 
 
334 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  28.57 
 
 
332 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  27.24 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  30.12 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  28.17 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  29.27 
 
 
333 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  29.27 
 
 
333 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  29.27 
 
 
333 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  29.27 
 
 
333 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  29.27 
 
 
333 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  29.27 
 
 
333 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  29.27 
 
 
333 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  28.11 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  30.59 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  26.33 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  25.93 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  29.44 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  27.89 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  29.51 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  30.89 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  29.53 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  31.07 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  30.89 
 
 
332 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  29.55 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  25.41 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.03 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  28 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  28 
 
 
323 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  28 
 
 
323 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  31.19 
 
 
334 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  25.67 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  27.33 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  26.93 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  26.11 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  25.67 
 
 
332 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  27.33 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  28.09 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  30.24 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.33 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  27.6 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  27.6 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  28.57 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  27.6 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  26.61 
 
 
320 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  25.67 
 
 
326 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  28.39 
 
 
314 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>