More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0480 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  61.89 
 
 
286 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  60.07 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  51.22 
 
 
286 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  50.69 
 
 
286 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  47.57 
 
 
331 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  49.29 
 
 
325 aa  208  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  42.36 
 
 
340 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  40.94 
 
 
292 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  43.56 
 
 
288 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 
295 aa  158  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 
307 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  41.58 
 
 
297 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.63 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  35.54 
 
 
304 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 
320 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 
320 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 
324 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 
323 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.93 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.15 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  33.56 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.16 
 
 
337 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  34.32 
 
 
336 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  36.03 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  31.54 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  36.26 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.77 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.51 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.68 
 
 
328 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  38.11 
 
 
315 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.12 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 
318 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  31.79 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  37.79 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  35.57 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  30.2 
 
 
336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.58 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.77 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  38.62 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  30.26 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  38.93 
 
 
344 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 
323 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 
329 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  33.11 
 
 
324 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  36.53 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  36.03 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  37.15 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  36.69 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  37.23 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.88 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.43 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  38.93 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  38.52 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  38.68 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  36.44 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  38.68 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  38.68 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  32.88 
 
 
329 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  32.44 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  38.52 
 
 
332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  30.33 
 
 
332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34.41 
 
 
334 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
314 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.92 
 
 
319 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  31.79 
 
 
329 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 
318 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.29 
 
 
323 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.96 
 
 
344 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  32.37 
 
 
322 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  36.29 
 
 
323 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  36.04 
 
 
305 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  31.46 
 
 
321 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  36.29 
 
 
323 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  37.74 
 
 
326 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.68 
 
 
318 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  34.93 
 
 
318 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  36.29 
 
 
323 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  38.46 
 
 
317 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.26 
 
 
319 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 
321 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  38.46 
 
 
333 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  36.44 
 
 
325 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  28.96 
 
 
302 aa  105  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  32.13 
 
 
321 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 
315 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.6 
 
 
318 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>