More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3484 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
307 aa  593  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  71.13 
 
 
295 aa  358  9e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  67.32 
 
 
292 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  64.92 
 
 
288 aa  333  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  63.67 
 
 
297 aa  310  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  39.56 
 
 
286 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  40.95 
 
 
288 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  41.39 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  38.68 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  37.27 
 
 
331 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  39.13 
 
 
291 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  36.2 
 
 
340 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  37.85 
 
 
286 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  40.46 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  34.77 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  35.41 
 
 
326 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  35.41 
 
 
326 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  35.41 
 
 
326 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  33.86 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  33.86 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  33.86 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  33.86 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  33.54 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  33.54 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  32.23 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  33.54 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  33.54 
 
 
325 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  33.86 
 
 
325 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 
329 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  34.8 
 
 
358 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.97 
 
 
324 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 
329 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  31.56 
 
 
324 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  37.75 
 
 
305 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  30.46 
 
 
325 aa  123  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 
329 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  31.48 
 
 
333 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.48 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  34.32 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.12 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  34.86 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  32.33 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.66 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  33.21 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  32.9 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  32.5 
 
 
332 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.49 
 
 
319 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  35.1 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  35.55 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.78 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  32.45 
 
 
327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.73 
 
 
344 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  35.35 
 
 
332 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  32.57 
 
 
322 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  31.23 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  28.66 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  32.57 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  32.3 
 
 
344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  30.07 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  30.07 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  31.6 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  30.9 
 
 
326 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.89 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  38.44 
 
 
322 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
322 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  31.39 
 
 
369 aa  112  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  29.56 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  35.91 
 
 
344 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  32.14 
 
 
355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  30.9 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  29.94 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  32.79 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  32.43 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  31 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  32.89 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  35.34 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  33.11 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  31 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  31.33 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  36.66 
 
 
300 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  30.67 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  30.69 
 
 
319 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 
323 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 
318 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  31.39 
 
 
315 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
315 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  34.74 
 
 
337 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  30.33 
 
 
318 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 
330 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  30.33 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 
323 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  30.19 
 
 
315 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  36.59 
 
 
337 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  35.5 
 
 
316 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>