More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2151 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
297 aa  574  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  62.63 
 
 
292 aa  317  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  63.51 
 
 
288 aa  310  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  63.67 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  62.41 
 
 
295 aa  291  6e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  40.19 
 
 
325 aa  175  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  36.08 
 
 
340 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  38.26 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 
331 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  42.11 
 
 
288 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  40.7 
 
 
291 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  35.81 
 
 
286 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  36.91 
 
 
286 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  37.62 
 
 
318 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  39.12 
 
 
323 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.76 
 
 
327 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  32.78 
 
 
332 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  36.23 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  30.29 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  29.39 
 
 
314 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.44 
 
 
315 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  31.83 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.55 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.21 
 
 
344 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  31.97 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30.64 
 
 
344 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  37.4 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  32.7 
 
 
339 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  32.65 
 
 
322 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 
315 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.05 
 
 
324 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 
320 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 
320 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 
320 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 
323 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30.23 
 
 
333 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  29.19 
 
 
318 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  32.76 
 
 
317 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  37.67 
 
 
330 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  34.32 
 
 
337 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  33.96 
 
 
322 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  32.11 
 
 
320 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  29.15 
 
 
346 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  32.1 
 
 
321 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  27.55 
 
 
318 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.97 
 
 
323 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.59 
 
 
323 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  35.22 
 
 
352 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 
324 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  36.13 
 
 
317 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  33.67 
 
 
322 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.87 
 
 
335 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.51 
 
 
323 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  35.91 
 
 
305 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  34.06 
 
 
315 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  31.63 
 
 
322 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  32.11 
 
 
325 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  28.72 
 
 
350 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  32.42 
 
 
322 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  32.47 
 
 
319 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  33.66 
 
 
324 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  29.37 
 
 
322 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
319 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  35.4 
 
 
322 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  33.66 
 
 
324 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  30.04 
 
 
339 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  30.17 
 
 
323 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 
331 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  31.12 
 
 
358 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
323 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  37.01 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
318 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  32.76 
 
 
321 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  35.25 
 
 
361 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 
317 aa  99  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  36.55 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.39 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  31.27 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.14 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  32.54 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  29.49 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.75 
 
 
343 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  32.64 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.01 
 
 
346 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  29.06 
 
 
355 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  28.37 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  28.97 
 
 
346 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 
346 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  31.75 
 
 
326 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  34.52 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>