More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1068 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 304 aa  599  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  55.34 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  54.23 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  40.41 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  39.38 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  42.59 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  37.42 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  40.82 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  37.5 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.94 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  37.15 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  32.79 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  38.57 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  34.44 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  39.56 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.17 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.17 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  35.88 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.17 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.7 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.7 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  34.32 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  38.6 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  30.63 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.68 
 
 		 326 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  33.45 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  38.71 
 
 		 330 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  35.54 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  35.69 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.04 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  35.17 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  34.96 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.86 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.86 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.86 
 
 		 325 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.86 
 
 		 325 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.86 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.86 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  35.86 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  36.11 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.07 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  35.86 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.11 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.11 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.11 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  36.11 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  37.21 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  32.18 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  31.27 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.77 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30.84 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  34.68 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.11 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  37.14 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.46 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  36.3 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.56 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  37.45 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  37.45 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.86 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.27 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  37.45 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  35.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  36.2 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  36.2 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  31.17 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  31.96 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  38.95 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  32.72 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  36.33 
 
 		 332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>