More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3160 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 325 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  96.62 
 
 		 325 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  85.23 
 
 		 325 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  67.08 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  68.9 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  65.75 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  57.4 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  56.97 
 
 		 323 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  54.13 
 
 		 323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  56.04 
 
 		 323 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  53.87 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  52.94 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  56.04 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  56.79 
 
 		 338 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  53.21 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  53.25 
 
 		 336 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  46.56 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  46.6 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  45.68 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  45.17 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  45.4 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  40.2 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  41.06 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  38.74 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.73 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  44.55 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.53 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  40.73 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  40.2 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.73 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  40.2 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  40.2 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  43.53 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  38.08 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  45.17 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  42.51 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  41.57 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  44.86 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  38.7 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  39.01 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  43.28 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  38.39 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  41.1 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  45.26 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  41.27 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  40.8 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  42.17 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  41.93 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  39.06 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  38.18 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  36.31 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.92 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  47.2 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  41.9 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.58 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.75 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  43.03 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  43.29 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  42.77 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  40.49 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  37.85 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  37.85 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  40.18 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  37.85 
 
 		 326 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  41.83 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  42.73 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  40.49 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  43.9 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  42.73 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  43.61 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  40.83 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.62 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  41.94 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.31 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  43.23 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  32.4 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  39.88 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  41.94 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  40.74 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  43.12 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  38.91 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  41.52 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  42.61 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>