More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3484 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
325 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  96.62 
 
 
325 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  84.62 
 
 
325 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  68 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  69.21 
 
 
331 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  66.06 
 
 
330 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  56.8 
 
 
331 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  57.28 
 
 
323 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  55.11 
 
 
323 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  57.59 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  55.11 
 
 
323 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  58.33 
 
 
338 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  56.35 
 
 
323 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  52.91 
 
 
323 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  54.13 
 
 
330 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  53.42 
 
 
336 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  46.41 
 
 
338 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  47.69 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  46.91 
 
 
324 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  46.91 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  46.01 
 
 
327 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  42 
 
 
318 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  40.13 
 
 
323 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  38.74 
 
 
338 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 
318 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  41.67 
 
 
318 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.44 
 
 
323 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 
318 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  44.08 
 
 
332 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  43.58 
 
 
326 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  40.13 
 
 
323 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  40.13 
 
 
323 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  39.81 
 
 
323 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  42.77 
 
 
331 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  46.15 
 
 
361 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  38.65 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  45.85 
 
 
361 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  44.35 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  43.41 
 
 
334 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  41.05 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  39.01 
 
 
318 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  42.07 
 
 
326 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.96 
 
 
333 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
319 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  38.7 
 
 
318 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  45.87 
 
 
323 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  43.48 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  42.77 
 
 
332 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  41.23 
 
 
315 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 
321 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  43.07 
 
 
332 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  44.55 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  43.94 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  36.53 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  41.72 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  39.38 
 
 
317 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  41.1 
 
 
322 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  39.14 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  39.14 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  39.14 
 
 
326 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  39.14 
 
 
326 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  43.33 
 
 
321 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  41.72 
 
 
335 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.91 
 
 
323 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  40.8 
 
 
322 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  35.49 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.74 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
314 aa  180  4e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  38.77 
 
 
324 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40.18 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  43.94 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 
318 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  38.49 
 
 
319 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  43.33 
 
 
332 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  37.12 
 
 
329 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35.91 
 
 
320 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  40.18 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.81 
 
 
329 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  41.54 
 
 
324 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.62 
 
 
326 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  39.6 
 
 
327 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  40.8 
 
 
322 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  43.03 
 
 
332 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  43.03 
 
 
332 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  43.79 
 
 
357 aa  175  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  40.8 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  32.4 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.31 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  39.94 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.81 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  40.37 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  41.82 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  42.26 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>