More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3537 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 324 aa  618  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  58.84 
 
 		 312 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  49.69 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  49.22 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  49.53 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  47.35 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  47.35 
 
 		 323 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  48.45 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  43.48 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  46.46 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  47.81 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  47.04 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  35.22 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  44.26 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  34.59 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  49.66 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  46.73 
 
 		 357 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  45.4 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  43.15 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  47.06 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  42.76 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  45.48 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  44.2 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  44.2 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  44.2 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  44.89 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  45.06 
 
 		 325 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  44.2 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  44.2 
 
 		 323 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  43.73 
 
 		 323 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  44.49 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  43.48 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  44.65 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  44.79 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  44.75 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  43.84 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  43.2 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  45.09 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  45.17 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  45.71 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  42.72 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  45.06 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  43.1 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  46.73 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  42.47 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  46.75 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  42.77 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  40.73 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  43.25 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  43.25 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  44.38 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  40.26 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  42.94 
 
 		 329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  42.6 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  45.31 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  43 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  43.25 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  43.25 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  43.25 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  43.25 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  43.25 
 
 		 325 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  42.07 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  42.07 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  42.94 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  43.56 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  42.94 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  42.07 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  43.25 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  38.99 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  44.79 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  46.13 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  45.09 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  38.99 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  45.09 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  41.77 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  38.91 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  44.16 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40.19 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  44.16 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  41.34 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  42.64 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  41.23 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  41.54 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  40.8 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  38.07 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  43.34 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  39.48 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  40.98 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  38.01 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  44.17 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  43.34 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  40.8 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  43.56 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  43.93 
 
 		 332 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  42.37 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  44.48 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  43.61 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>