More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2773 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 310 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  55.59 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  51.92 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  45.4 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  45.85 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  46.01 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.19 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  45.85 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  44.69 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  45.48 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.88 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  36.88 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  36.88 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  45.31 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  36.88 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  37.22 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  46.38 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  45.22 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  47.79 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  45.3 
 
 		 325 aa  168  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  36.57 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  46.36 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.57 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  42.48 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  36.25 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  44.41 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  36.25 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.06 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  40.4 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  34.38 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  44.96 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  42.24 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  41.58 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.38 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  31.65 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  38.95 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  37.12 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  41.02 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 		 326 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  40.73 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  36.63 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  37.77 
 
 		 336 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  40.8 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.8 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.8 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  37.22 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  40.47 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.91 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.91 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  46.04 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  38.2 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  40.74 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  37.23 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  40.13 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  34.95 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  38.2 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  37.83 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.02 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  39.53 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  37.11 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  35.96 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  38.2 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  37.83 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.41 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  39.58 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  43 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  36.59 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  36.59 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  38.98 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  29.97 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.76 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.76 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  37.88 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  36.79 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  39.64 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  38 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  37.71 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  40.48 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.44 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  41.99 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  38.83 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  32.01 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  39.55 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  35.78 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.63 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  40.64 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  38.51 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>