More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0376 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
315 aa  636    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  89.52 
 
 
315 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  88.57 
 
 
314 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  73.97 
 
 
315 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  55.21 
 
 
327 aa  334  1e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  31.84 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  32.2 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  34.46 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  31.6 
 
 
320 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  32.8 
 
 
340 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.99 
 
 
348 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  27.16 
 
 
324 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.71 
 
 
323 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  28.27 
 
 
317 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  28.18 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  27.1 
 
 
326 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  28.17 
 
 
339 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  30.58 
 
 
355 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.54 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.87 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  29.97 
 
 
318 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  30.47 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  28.15 
 
 
316 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  28.67 
 
 
336 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  29.07 
 
 
354 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  27.42 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  26.71 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  29.8 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  31.76 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  29.08 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
330 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  26.4 
 
 
324 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  26.59 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  28.38 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  26.52 
 
 
319 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  26.01 
 
 
335 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  28.72 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  31.21 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  30.34 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  28.32 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  28.05 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  29.55 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  28.09 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  27.08 
 
 
365 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
363 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  31.37 
 
 
352 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  28.47 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  28.38 
 
 
361 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  30.89 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  27.85 
 
 
369 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  28.05 
 
 
326 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  29.24 
 
 
339 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  31.75 
 
 
354 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  25.98 
 
 
321 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
329 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  27.64 
 
 
329 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  29.47 
 
 
325 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
355 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 
346 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  29.03 
 
 
322 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 
344 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.91 
 
 
335 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  27.41 
 
 
319 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  27.45 
 
 
321 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  28.4 
 
 
318 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  27.33 
 
 
329 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  27.64 
 
 
329 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  27.36 
 
 
332 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  27.96 
 
 
318 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  24.85 
 
 
322 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  28.25 
 
 
340 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  28.92 
 
 
324 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  28.92 
 
 
324 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  28.8 
 
 
315 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  27.74 
 
 
358 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  26.03 
 
 
332 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  27.33 
 
 
334 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  29.58 
 
 
334 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  28.22 
 
 
286 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  26.58 
 
 
319 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  26.25 
 
 
333 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 
319 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  27.89 
 
 
331 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  27.9 
 
 
335 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  26.64 
 
 
323 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  25.08 
 
 
319 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  29.43 
 
 
323 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  28.41 
 
 
332 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.67 
 
 
344 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  26.73 
 
 
324 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>