More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1192 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
291 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  61.67 
 
 
286 aa  351  7e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  60.07 
 
 
288 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  51.39 
 
 
286 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  50.52 
 
 
286 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  43.1 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  42.07 
 
 
331 aa  188  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  43.05 
 
 
325 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  38.93 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  40.47 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  38.82 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  40.35 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  37.72 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.63 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
323 aa  122  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  33.88 
 
 
325 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  31 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.86 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.44 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  29.47 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  32.31 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  29.57 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.94 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.8 
 
 
315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  36.21 
 
 
344 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  32.2 
 
 
319 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
316 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  36.33 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.89 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  36.48 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.25 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  33.93 
 
 
323 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  36.84 
 
 
334 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  30.43 
 
 
321 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  29.24 
 
 
306 aa  109  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 
333 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  35.8 
 
 
332 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  34.27 
 
 
365 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 
332 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.47 
 
 
320 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  35.8 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  36.48 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  36.48 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  30.84 
 
 
332 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.57 
 
 
329 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
318 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  32.02 
 
 
318 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 
319 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 
344 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  34.51 
 
 
337 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
318 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  36.21 
 
 
319 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
318 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  32.4 
 
 
315 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  32.26 
 
 
318 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 
320 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  32.8 
 
 
323 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  28.52 
 
 
336 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  34.68 
 
 
315 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  27.8 
 
 
336 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  33.73 
 
 
326 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 
323 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 
323 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.56 
 
 
329 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 
323 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  26.86 
 
 
327 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  36.09 
 
 
329 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  33.2 
 
 
324 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.05 
 
 
344 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 
323 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.8 
 
 
318 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  32.79 
 
 
320 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  36.09 
 
 
329 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  32.79 
 
 
320 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 
344 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  34.26 
 
 
332 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
304 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  32.94 
 
 
326 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  33.6 
 
 
324 aa  99  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.44 
 
 
329 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  30.94 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  33.89 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  27.46 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  29.1 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  32.01 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.1 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  25.93 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  35.76 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  31.46 
 
 
325 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  33.46 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>