More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2128 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
331 aa  669    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  55.21 
 
 
340 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  51.41 
 
 
325 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  47.57 
 
 
288 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 
286 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  42.07 
 
 
291 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  41.38 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  41.36 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  35.79 
 
 
337 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  37.8 
 
 
292 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  38.8 
 
 
288 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.19 
 
 
320 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.19 
 
 
320 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.11 
 
 
323 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  31.52 
 
 
322 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  31.52 
 
 
322 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  33.66 
 
 
323 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
324 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  32.92 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  32.88 
 
 
322 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  36.65 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  31.19 
 
 
322 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  33.57 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  32.31 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  29.65 
 
 
358 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.03 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  36.95 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  32.12 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  33.56 
 
 
321 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
315 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30.24 
 
 
344 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  33.45 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  33.86 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  32.78 
 
 
327 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  31.06 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  31.71 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  31.38 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  30.18 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  30.09 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  32.42 
 
 
320 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  31.19 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  30.58 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.84 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  32.49 
 
 
315 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 
346 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
331 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  31.15 
 
 
346 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  29.45 
 
 
327 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  33.11 
 
 
321 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 
325 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  36.1 
 
 
305 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  31.75 
 
 
329 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  34.63 
 
 
322 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  31.07 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.32 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  32.81 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  30.19 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.34 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  31.89 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.66 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30.58 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  28.53 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.66 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  31.65 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  30.65 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  27.46 
 
 
338 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  32.58 
 
 
317 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.89 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  29.29 
 
 
319 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  32.68 
 
 
320 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  29.23 
 
 
355 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  30.71 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  31.97 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  34.52 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  29.97 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.16 
 
 
348 aa  115  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  32.05 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  32.65 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  31.54 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  32.21 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  31.37 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  29.75 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0476  thiamine-phosphate kinase  31.67 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  30.64 
 
 
319 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 
336 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  30.33 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  31.88 
 
 
325 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  31.88 
 
 
325 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  31.88 
 
 
325 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  31.88 
 
 
325 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.32 
 
 
346 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>