More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0460 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
315 aa  634    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  89.52 
 
 
315 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  90.16 
 
 
314 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  74.29 
 
 
315 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  54.91 
 
 
327 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  30.65 
 
 
339 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
286 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  27.74 
 
 
324 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  32.49 
 
 
331 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 
318 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  27.49 
 
 
323 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  27.74 
 
 
317 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  27.81 
 
 
339 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  28.15 
 
 
316 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  28.25 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  25.77 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  30.86 
 
 
318 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  26.89 
 
 
321 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  32.15 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  29.53 
 
 
355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  28.37 
 
 
326 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  28.95 
 
 
336 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  29.11 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  26.73 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.97 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  25.98 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  29.47 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  29.04 
 
 
306 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.28 
 
 
348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  28.9 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  25.87 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.01 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30.35 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  28.47 
 
 
361 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  27.16 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  26.75 
 
 
315 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  25.47 
 
 
335 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  25.38 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  27.76 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  28.28 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  27.65 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  26.92 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  27.97 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  26.13 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  28.14 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  26.37 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  25.99 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  25.89 
 
 
332 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 
352 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  29.85 
 
 
339 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  28.12 
 
 
322 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  28.57 
 
 
346 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  28.94 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  28.85 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  27.9 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  28.94 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  27.06 
 
 
334 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  28.97 
 
 
321 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 
365 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  27.52 
 
 
326 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  27.59 
 
 
335 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  29.35 
 
 
322 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  31.45 
 
 
344 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  28.13 
 
 
330 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  28.47 
 
 
340 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  27 
 
 
333 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 
319 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.42 
 
 
344 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  29.12 
 
 
319 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 
321 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  26.77 
 
 
319 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 
333 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  25.47 
 
 
332 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  26.56 
 
 
318 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  25.08 
 
 
319 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 
297 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 
288 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  28.22 
 
 
286 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  27.83 
 
 
326 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  26.21 
 
 
323 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  28.89 
 
 
328 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  26.56 
 
 
317 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
346 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.51 
 
 
335 aa  103  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  26.43 
 
 
324 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  27.82 
 
 
331 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  27.76 
 
 
332 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  25.88 
 
 
321 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  28.87 
 
 
324 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 
333 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 
333 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 
333 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 
333 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 
333 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  26.06 
 
 
321 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>