More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3453 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  100 
 
 		 334 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  41.02 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  43.49 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  42.11 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  41.64 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  41.06 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  40.76 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  41.06 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  45.1 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  39.64 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  41.67 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  42.73 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  40.95 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  42.73 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  42.43 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  42.9 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  42.43 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  39.31 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.48 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  41.06 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.48 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  38.42 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  40.65 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  40.48 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.48 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  40.18 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  40.18 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  41.42 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  40.18 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  41.42 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  40.9 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  41.42 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  41.42 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  40.18 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  44.21 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  41.76 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  38.58 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  42.09 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  39.88 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  39.17 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  41.28 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  41.28 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  38.39 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  39.53 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  37.98 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  38.64 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  39.76 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.98 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  41.49 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  39.07 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  40.65 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  38.75 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  39 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  39.58 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  42.14 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  39.94 
 
 		 361 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  39.47 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  39.64 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  40.29 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  41.84 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  36.21 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  35.99 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  41.47 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  37.69 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  37.87 
 
 		 324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  36.21 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  36.75 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  38.1 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  40.6 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  39.76 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  39 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  38.17 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  38.96 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0573  thiamine-monophosphate kinase  37.91 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.929555  normal  0.0493584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  40.3 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  38.24 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  38.24 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  35.52 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  41.67 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  38.3 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  35.51 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  40.21 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  38.94 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>