More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1297 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  69.2 
 
 
292 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  64.92 
 
 
307 aa  315  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  64.13 
 
 
295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  63.51 
 
 
297 aa  298  7e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  43.26 
 
 
286 aa  178  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  44.19 
 
 
325 aa  175  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  39.67 
 
 
340 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  43.56 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  39.6 
 
 
286 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  38.8 
 
 
331 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  41.2 
 
 
291 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  38.33 
 
 
286 aa  152  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  39.07 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  37.81 
 
 
323 aa  128  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  30.17 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  34.69 
 
 
336 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 
315 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  27.81 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  37.41 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  34.34 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.34 
 
 
329 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.34 
 
 
329 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  29.5 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  34.01 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  37.62 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  37.37 
 
 
305 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  31.86 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  32.66 
 
 
333 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  34.94 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  31.97 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  30.85 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  33.09 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.14 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.34 
 
 
327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  34.14 
 
 
324 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  31.07 
 
 
302 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 
304 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.17 
 
 
323 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
315 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 
318 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  28.86 
 
 
325 aa  106  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  30.3 
 
 
323 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  30.17 
 
 
323 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 
318 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 
318 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  32.45 
 
 
325 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
323 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.68 
 
 
334 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
323 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  31.88 
 
 
321 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  31.99 
 
 
318 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  30.11 
 
 
330 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  29.69 
 
 
318 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  31.5 
 
 
319 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  32.55 
 
 
326 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  32.55 
 
 
326 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  32.55 
 
 
326 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  32.55 
 
 
326 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.27 
 
 
346 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  31.48 
 
 
358 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  32.62 
 
 
321 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  40.71 
 
 
332 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  34.91 
 
 
324 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
344 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  30.43 
 
 
320 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  32.67 
 
 
327 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.43 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
332 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  30.4 
 
 
334 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  30.89 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  34.73 
 
 
332 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  34.23 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  34.56 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  34.87 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  33.09 
 
 
344 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 
355 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  31.65 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  31.65 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  32.99 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  31.65 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  33.8 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  31.65 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  34.92 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  25.28 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  32.18 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  32.21 
 
 
325 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  40.49 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  28.42 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  31.31 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  36.14 
 
 
337 aa  96.3  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  32.31 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  31.31 
 
 
325 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>