More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1448 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  29.27 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  27.52 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  26.84 
 
 		 338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  25.98 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  27.18 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  28.05 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  30.93 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  25.27 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  28.13 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  27.18 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  27.78 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.37 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  25.86 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  27.22 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  29.04 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  27.21 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  28.36 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  27.18 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.554976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  26.8 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  25.5 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  25.5 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  27.38 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  25.61 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  26.69 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  25.76 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  28.03 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  28.02 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.76 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  27.65 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  25.76 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  27.8 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  27.53 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  26.01 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  31.05 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  27.24 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  26.07 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  26.8 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  31.21 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  27.24 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  27.24 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  27.24 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  25.47 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  26.32 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  26.47 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  27.24 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  26.15 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  24.22 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  25.76 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  26.47 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  27.24 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  25.17 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  27.24 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  26.9 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  26.9 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  26.32 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  29.55 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  27.27 
 
 		 346 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  23.68 
 
 		 319 aa  99  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  24.83 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  24.83 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  27.84 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  27.52 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  27.03 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  30.36 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.259718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  27.87 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  26.19 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  24.83 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  24.3 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  26.01 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  25.96 
 
 		 323 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0024  thiamine-phosphate kinase  30.03 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  27.24 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  26.95 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  26.01 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  25.66 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  27.53 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0476  thiamine-phosphate kinase  25.39 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  30.21 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  27.18 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  27.04 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  26.62 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  26.04 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  27.53 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0170  thiamine monophosphate kinase-like protein  27.52 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  25 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  27.52 
 
 		 355 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  28.32 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  24.75 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  30.74 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  25.17 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  26.55 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>