More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0702 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
277 aa  546  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1451  thiamine monophosphate kinase  56.68 
 
 
273 aa  300  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1632  thiamine monophosphate kinase  56.32 
 
 
273 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1793  thiamine monophosphate kinase  55.96 
 
 
273 aa  295  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  48.92 
 
 
274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  51.62 
 
 
273 aa  277  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  51.62 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  51.8 
 
 
272 aa  269  5e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  47.29 
 
 
273 aa  265  8e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  46.21 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  27.5 
 
 
337 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  28.1 
 
 
329 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  29.6 
 
 
333 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.47 
 
 
318 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  29.86 
 
 
334 aa  118  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  30.5 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  28.72 
 
 
350 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  26.6 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  30.35 
 
 
318 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  25.6 
 
 
358 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
343 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  29.18 
 
 
344 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.72 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.64 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.64 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  29.52 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  31.11 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 
355 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  28.91 
 
 
327 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  29.56 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  27.08 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  29.45 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  28.81 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  26.39 
 
 
346 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
354 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  28.93 
 
 
321 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  28.15 
 
 
336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  27.78 
 
 
336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  29.82 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 
340 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  28.23 
 
 
346 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  28.36 
 
 
328 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  29.74 
 
 
355 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  27.05 
 
 
348 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  32.48 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  28.88 
 
 
321 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  26.3 
 
 
336 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  27.14 
 
 
355 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  29.74 
 
 
363 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  28.36 
 
 
331 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  28.37 
 
 
318 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  27.47 
 
 
352 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  26.38 
 
 
346 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  27.35 
 
 
355 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  26.21 
 
 
324 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  30.07 
 
 
330 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  29.09 
 
 
319 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  32.94 
 
 
320 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  29.3 
 
 
323 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  28.38 
 
 
318 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  30.85 
 
 
317 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  28.76 
 
 
329 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  28.98 
 
 
325 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  27.34 
 
 
369 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  27.92 
 
 
298 aa  102  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  28.76 
 
 
329 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  29.89 
 
 
322 aa  102  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  30.53 
 
 
315 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  31.05 
 
 
310 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  28.76 
 
 
329 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  25.96 
 
 
332 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 
314 aa  102  9e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
317 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  27.05 
 
 
326 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 
334 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  26.73 
 
 
341 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 
325 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  29.86 
 
 
323 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  26.69 
 
 
326 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  28.16 
 
 
337 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  26.47 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  27.76 
 
 
324 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  30.04 
 
 
323 aa  99  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  28.76 
 
 
354 aa  99  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  28.69 
 
 
315 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  26.81 
 
 
306 aa  98.6  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  28.83 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  29.38 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  27.11 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  29.33 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  28.06 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0573  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.929555  normal  0.0493584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  35.97 
 
 
370 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  30.57 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  31.67 
 
 
329 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  26.24 
 
 
335 aa  95.5  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  27.02 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  29.14 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>