More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0405 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1451  thiamine monophosphate kinase  65.57 
 
 		 273 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1632  thiamine monophosphate kinase  65.2 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1793  thiamine monophosphate kinase  64.84 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  49.82 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  52.19 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  51.65 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  51.62 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  51.09 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  47.25 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  28.2 
 
 		 358 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  33.81 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  29.51 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  27.56 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  27.56 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  27.64 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.89 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  29.7 
 
 		 333 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  28.84 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  30.35 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  27.78 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  28.68 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  28.01 
 
 		 363 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  33.06 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  26.39 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  27.3 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  30.56 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.46 
 
 		 324 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30.4 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  27.6 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  28.63 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  28.1 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  27.69 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  34.33 
 
 		 329 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  31.91 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  25.91 
 
 		 336 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  26.91 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  28.36 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  27.27 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.19 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  26.81 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  29.23 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  28.52 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.66 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  26.2 
 
 		 346 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  24.52 
 
 		 355 aa  99.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  32.35 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  29.05 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  27.9 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  30.89 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  27.82 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  27.88 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  25.91 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  29.25 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  29.88 
 
 		 356 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  29.08 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  36.24 
 
 		 370 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  29.08 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 		 323 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  29.58 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.13 
 
 		 343 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  28.8 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  25.36 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  30.27 
 
 		 323 aa  96.3  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  30.92 
 
 		 344 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  26.95 
 
 		 323 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  27.11 
 
 		 340 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  26.97 
 
 		 350 aa  95.5  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  26.95 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  26.95 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  26.33 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  26.56 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  29.62 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  26.01 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  26.56 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  26.81 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  28.12 
 
 		 334 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 		 334 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  26.56 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  25.57 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  25.49 
 
 		 340 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  25.89 
 
 		 319 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 		 330 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  29.1 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  27.97 
 
 		 335 aa  92  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  26.47 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  33.56 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  26.22 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  26.77 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  24.91 
 
 		 339 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  26.98 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>