More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1031 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 275 aa  563  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  50.36 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  43.59 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  47.25 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  46.21 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1451  thiamine monophosphate kinase  45.42 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1632  thiamine monophosphate kinase  45.42 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1793  thiamine monophosphate kinase  44.32 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  45.05 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  41.97 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  30.15 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  31.87 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  31.87 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  32.02 
 
 		 332 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  31.21 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  28.21 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  32.17 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  31.03 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  27.84 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  27.52 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  28.67 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  28.82 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  31.73 
 
 		 333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  27.84 
 
 		 336 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  30.16 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  30.05 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  28.07 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  26.13 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  29.64 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  27.88 
 
 		 325 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 		 338 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  28.46 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  29.18 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.43 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  27.96 
 
 		 343 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  31.77 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.74 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  31.42 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  26.87 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  30.43 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.56 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  29.35 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  27.67 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.59 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  27.82 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  29.39 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  29.6 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  27.84 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  29.72 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  29.55 
 
 		 310 aa  99  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.34 
 
 		 350 aa  99  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  26.81 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.88 
 
 		 323 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  30.12 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  29.52 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  30.2 
 
 		 323 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  29.72 
 
 		 344 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  30.2 
 
 		 323 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  30.47 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  30.2 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  35.37 
 
 		 370 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  31.86 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  30.27 
 
 		 372 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  29.15 
 
 		 355 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  29.46 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.46 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  29.46 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.97 
 
 		 352 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  29.02 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  27.62 
 
 		 322 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  28.21 
 
 		 363 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.92 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  27.24 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  28.14 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  27.08 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  26.36 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 340 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  28.42 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  28.32 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  25.99 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  30.09 
 
 		 346 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  27.21 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 330 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.1 
 
 		 335 aa  92  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.72 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  27.5 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  29.84 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  28.99 
 
 		 375 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  28.21 
 
 		 319 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  28.86 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  25.64 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  27.27 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  28.36 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  28.86 
 
 		 329 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>