More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0773 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  63 
 
 
273 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  52.55 
 
 
272 aa  296  3e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  49.82 
 
 
273 aa  290  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1451  thiamine monophosphate kinase  50.92 
 
 
273 aa  285  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1793  thiamine monophosphate kinase  50.18 
 
 
273 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1632  thiamine monophosphate kinase  50.18 
 
 
273 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202081  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  44.53 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  47.29 
 
 
277 aa  265  8e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  43.59 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
355 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.37 
 
 
334 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
354 aa  132  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 
329 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.02 
 
 
346 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
344 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  32.44 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 
369 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.96 
 
 
363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 
344 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  37.55 
 
 
343 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  29.1 
 
 
358 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  33.69 
 
 
331 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 
348 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  30.5 
 
 
339 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  33.09 
 
 
328 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.79 
 
 
346 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 
350 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 
330 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  27.8 
 
 
355 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 
333 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
355 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  35.02 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  30.92 
 
 
323 aa  118  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 
346 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  29.86 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  34.25 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  32.37 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  33.2 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  34 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  31.48 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  29.67 
 
 
318 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 
324 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  33.47 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  37.91 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  28.32 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.32 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  30.28 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  26.57 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  29.67 
 
 
318 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  29.6 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  32.93 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  28.81 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  33.7 
 
 
325 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
352 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.05 
 
 
318 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  31.41 
 
 
372 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.03 
 
 
337 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  31.18 
 
 
325 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 
314 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  31.6 
 
 
328 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  34.7 
 
 
344 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 
319 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  29.88 
 
 
306 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  32 
 
 
333 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  30.43 
 
 
318 aa  105  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 
338 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.72 
 
 
319 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  28.73 
 
 
319 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 
338 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  33.07 
 
 
327 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  30.69 
 
 
339 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  29.56 
 
 
313 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  29.29 
 
 
354 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  31.45 
 
 
326 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  27.8 
 
 
310 aa  102  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  40.27 
 
 
370 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  33.2 
 
 
327 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  31.16 
 
 
326 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  30.24 
 
 
319 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
324 aa  102  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  30.55 
 
 
325 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  29.86 
 
 
323 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 
323 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
314 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 
323 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  31.39 
 
 
325 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  27.05 
 
 
320 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  31.39 
 
 
325 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  35.43 
 
 
321 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  30.8 
 
 
326 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  34.33 
 
 
300 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  30.8 
 
 
326 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  31.39 
 
 
325 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>