More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1042 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  63 
 
 
273 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  51.65 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  50 
 
 
274 aa  274  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  51.62 
 
 
277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  51.82 
 
 
272 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1451  thiamine monophosphate kinase  50.18 
 
 
273 aa  258  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1793  thiamine monophosphate kinase  48.72 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1632  thiamine monophosphate kinase  49.08 
 
 
273 aa  252  6e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  45.05 
 
 
275 aa  235  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
355 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 
354 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  30.86 
 
 
358 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  30.56 
 
 
355 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.21 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  30.24 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.23 
 
 
336 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  29.58 
 
 
336 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  31.47 
 
 
317 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.7 
 
 
325 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  28.99 
 
 
323 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 
339 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  32.21 
 
 
346 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  31.87 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  31.29 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.28 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  33.58 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  31.18 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 
344 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 
337 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  32.12 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  30.24 
 
 
305 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  33.58 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.22 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  31.89 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  29.09 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  34.27 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  35.61 
 
 
318 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  31.88 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  32.64 
 
 
330 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.08 
 
 
318 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  31.95 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  31.8 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  32.4 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  26.42 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  29.37 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  32.76 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.33 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.95 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 
352 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  33.09 
 
 
339 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  33.2 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  28.22 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 
346 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  31.58 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  32.68 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  32.68 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  30.69 
 
 
329 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  32.68 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  32.68 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
323 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  32.18 
 
 
333 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  29.33 
 
 
326 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  30.08 
 
 
322 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  39.46 
 
 
370 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  32.43 
 
 
323 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  31.34 
 
 
339 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  31.92 
 
 
326 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.04 
 
 
324 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  30.07 
 
 
334 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 
316 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.18 
 
 
329 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  31.92 
 
 
326 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  28.46 
 
 
338 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  33.07 
 
 
327 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  29.29 
 
 
319 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  28.4 
 
 
344 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  30.36 
 
 
315 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  28.51 
 
 
314 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.18 
 
 
329 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  29.5 
 
 
337 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.18 
 
 
329 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  32.22 
 
 
314 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  31.4 
 
 
300 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  30.53 
 
 
298 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  28.41 
 
 
341 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  29.77 
 
 
325 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  26.5 
 
 
375 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  32.68 
 
 
321 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  31.13 
 
 
324 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  28.07 
 
 
315 aa  103  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
319 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  30.08 
 
 
319 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>