More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0476 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0476  thiamine-phosphate kinase  100 
 
 
312 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  29.11 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  33.86 
 
 
325 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  31.67 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  35.67 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  32.26 
 
 
319 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  32.94 
 
 
330 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  29.43 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  29.43 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  30.16 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  31.49 
 
 
332 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  31.47 
 
 
333 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  32.57 
 
 
340 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 
338 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  33.69 
 
 
319 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
305 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 
332 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  33.1 
 
 
338 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  32.46 
 
 
320 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  26.96 
 
 
314 aa  106  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.91 
 
 
319 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 
324 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.9 
 
 
329 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  30.22 
 
 
323 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  28.52 
 
 
323 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 
324 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 
324 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 
355 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 
334 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  28.07 
 
 
323 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  28.67 
 
 
339 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  31.71 
 
 
322 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  28.85 
 
 
323 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  29.58 
 
 
323 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 
323 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  28.85 
 
 
323 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 
337 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  32.27 
 
 
322 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  29.79 
 
 
319 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  32.43 
 
 
331 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  31.58 
 
 
321 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  30.31 
 
 
323 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.12 
 
 
363 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  28.29 
 
 
352 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  30.8 
 
 
322 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  29.63 
 
 
318 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  28.46 
 
 
318 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  28.46 
 
 
318 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  31.27 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.05 
 
 
348 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  28.77 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  28.46 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 
323 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  31.4 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30.03 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  28.66 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.55 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  25.39 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  32.09 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  31.01 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  32.75 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  28.06 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  29.79 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0024  thiamine-phosphate kinase  27.46 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  29.62 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  32.98 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  32.29 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  31.56 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  30.3 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  30.96 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  32.92 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  29.84 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.79 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  30.94 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1646  thiamine monophosphate kinase-like protein  28.25 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  31.12 
 
 
319 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  31.52 
 
 
334 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  28.83 
 
 
355 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  26.3 
 
 
344 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  27.67 
 
 
355 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.99 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  28.94 
 
 
354 aa  92.4  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  27.4 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  31.92 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  32.29 
 
 
315 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  29.22 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  30.47 
 
 
317 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  27.92 
 
 
321 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  29.3 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.21 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.27 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  29.81 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>