More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02615 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  100 
 
 		 417 aa  865    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  47.64 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  43 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  42.5 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  36.81 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.23 
 
 		 503 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  35.29 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.6 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  37.18 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.59 
 
 		 475 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  33.42 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.89 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  35.04 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  39.37 
 
 		 517 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.42 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.93 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.61 
 
 		 475 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.61 
 
 		 473 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.93 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  35.36 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  36.28 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.96 
 
 		 439 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  35.59 
 
 		 491 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  32.36 
 
 		 741 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  34.68 
 
 		 523 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.92 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  32.25 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.65 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  35.31 
 
 		 475 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  34.92 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.84 
 
 		 491 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.99 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  34.28 
 
 		 482 aa  193  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.92 
 
 		 490 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  33.99 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  40.22 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  35.47 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.56 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  31.6 
 
 		 479 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.53 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  33.99 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  33.61 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  32.79 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  38.93 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  31.7 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  31.44 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  31.44 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  35.38 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  32.95 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  32.79 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.96 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.26 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  31.85 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  31.85 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  31.85 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  29.85 
 
 		 477 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  30.63 
 
 		 470 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  30.36 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.98 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  30.7 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  31.07 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  29.55 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  32.59 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  29.6 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  33.7 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  30.14 
 
 		 470 aa  163  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  29.24 
 
 		 440 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  31.94 
 
 		 513 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  32.81 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  30.26 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  29.15 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  31.47 
 
 		 533 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  30.49 
 
 		 490 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  30.42 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  30.42 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  30.42 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  30.42 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.73 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  29.53 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  30.14 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  33.33 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  30.83 
 
 		 437 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.82 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  27.59 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  31.99 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  29.49 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  29.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  29.81 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  32.97 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  29.59 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  29.97 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.46 
 
 		 569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  29.97 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>