More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0583 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 
231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  56 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.77 
 
 
227 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  54.7 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  55.98 
 
 
237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.53 
 
 
231 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.57 
 
 
226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.23 
 
 
226 aa  194  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
234 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  52.99 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  52.99 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  52.99 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  50 
 
 
241 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.68 
 
 
225 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.96 
 
 
222 aa  174  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
234 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
233 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 
228 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
237 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
246 aa  147  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  47.7 
 
 
1695 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.89 
 
 
236 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
233 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
234 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
236 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
237 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
235 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
235 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4813  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
239 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
250 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.71 
 
 
231 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
244 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
235 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 
236 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
256 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
268 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.73 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
254 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.26 
 
 
232 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
246 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0594  putative short-chain type dehydrogenase  33.61 
 
 
252 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.722821  normal  0.132881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  33.06 
 
 
248 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 
2031 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11970  short-chain type dehydrogenase/reductase  33.06 
 
 
256 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.675496  normal  0.543432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
257 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2429  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.35 
 
 
247 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047151  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
257 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.29 
 
 
246 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
253 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562893  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.08 
 
 
248 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.17 
 
 
248 aa  102  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
247 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.68 
 
 
260 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
246 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
268 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
241 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
245 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.96 
 
 
247 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
247 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1374  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
247 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
282 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1089  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
244 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 
261 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.93 
 
 
245 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.86 
 
 
247 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
233 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
233 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
233 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
249 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  31.2 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.92 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
251 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  36.4 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
275 aa  99.4  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115875  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.75 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  30.58 
 
 
247 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2122  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.38 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
249 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
254 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1874  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.47 
 
 
245 aa  98.2  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00756891  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.38 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  30.58 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1587  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000600536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>