More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4557 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  77.62 
 
 		 430 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  77.49 
 
 		 458 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  78.35 
 
 		 436 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  859    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  77.62 
 
 		 430 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  77.39 
 
 		 465 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  83.99 
 
 		 435 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  77.31 
 
 		 435 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  77.62 
 
 		 430 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  77.62 
 
 		 466 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  77.73 
 
 		 461 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  98.38 
 
 		 433 aa  848    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  77.49 
 
 		 458 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  77.62 
 
 		 430 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  78.19 
 
 		 436 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  77.62 
 
 		 430 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  77.96 
 
 		 436 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  71.79 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  71.1 
 
 		 442 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  68.82 
 
 		 438 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  68.82 
 
 		 438 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  70.52 
 
 		 436 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  68.84 
 
 		 432 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  68.2 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  68.93 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  68.45 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  68.45 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  69.63 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  68.2 
 
 		 445 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  69.81 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  66.75 
 
 		 436 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  63.4 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  64.41 
 
 		 435 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 459 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  62.77 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  64.76 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  62.77 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  59.47 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  61.97 
 
 		 445 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  62.2 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  62.22 
 
 		 442 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  63.4 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  58.85 
 
 		 476 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  58.85 
 
 		 476 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  59.47 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  59.9 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  59.2 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  59.07 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  52.18 
 
 		 437 aa  431  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  58.71 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  53.03 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  51.01 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  51.21 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  46.74 
 
 		 436 aa  358  7e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  46.61 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  45.85 
 
 		 436 aa  356  5.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  45.83 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  51.45 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  46.21 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  50.97 
 
 		 441 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  43.62 
 
 		 432 aa  329  7e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  50.72 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  41.82 
 
 		 431 aa  322  7e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  39.9 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  39.7 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  36.88 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  36.88 
 
 		 415 aa  262  8e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  36.21 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.01 
 
 		 443 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.77 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  36.85 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  33.97 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  30.08 
 
 		 483 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 485 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  29.82 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  29.82 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  29.57 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  29.82 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.82 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  29.82 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  29.82 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.82 
 
 		 485 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.89 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  34.89 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  30.67 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>