More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2733 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 307 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  53.87 
 
 		 308 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 311 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  49.32 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 314 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 306 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 306 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 302 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 306 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 304 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  48.63 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 308 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 307 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  47.26 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  46.46 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  47.44 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  47.37 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3552  LysR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 428 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.313254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 321 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01757  hypothetical protein  42.66 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 300 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2525  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2025  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000110123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1834  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1887  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 335 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1630  LysR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3068  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.254873  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0015  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0012  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1519  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1441  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0015  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1160  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.4 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  43.71 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5765  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1844  transcriptional regulator, LysR family  42.31 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.45 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0208652  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5033  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43 
 
 		 319 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0915  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  36.51 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0365  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.916337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000622  transcriptional regulator  38.08 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0426  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144523  hitchhiker  0.000318501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0367  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 321 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0374  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 321 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1511  LysR family substrate binding transcriptional regulator  41.26 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1615  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.502684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1757  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  41.26 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>