69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1927 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  100 
 
 		 350 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  82.57 
 
 		 350 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  53.41 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  39.37 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  32.52 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  30.05 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  28.76 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  27.06 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  28.43 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  26.98 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  27.51 
 
 		 342 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  28.57 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  29.64 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  26.96 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.49 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  25.29 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  26.25 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  27.14 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  26.24 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  26.38 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.79 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  26.86 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  26.84 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  29.02 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  28.31 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  28.31 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  26.29 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  26.29 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  26.29 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.67 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.41 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.89 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  23.47 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2649  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 160 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.82 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  30.25 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  29.03 
 
 		 340 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.79 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.18 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  27.07 
 
 		 339 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  27.41 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.45 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.45 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  25.49 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.57 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  22.91 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.55 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.94 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  21.77 
 
 		 451 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  30.88 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  26.83 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  21.37 
 
 		 451 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.24 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  28 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.39 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 200 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  27.69 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>