More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0276 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  85.35 
 
 		 525 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 557 aa  1137    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  85.05 
 
 		 517 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  85.35 
 
 		 525 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  76.48 
 
 		 532 aa  823    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  76.48 
 
 		 532 aa  820    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  76.66 
 
 		 531 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  85.35 
 
 		 525 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  77.2 
 
 		 525 aa  845    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  77.02 
 
 		 535 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  83.48 
 
 		 544 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  85.05 
 
 		 517 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  83.3 
 
 		 538 aa  917    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  85.35 
 
 		 525 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  76.66 
 
 		 532 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  77.02 
 
 		 535 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  85.05 
 
 		 517 aa  690    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  76.66 
 
 		 532 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  71.07 
 
 		 418 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  70.81 
 
 		 418 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  74.3 
 
 		 390 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  64.25 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  66.93 
 
 		 422 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  66.48 
 
 		 385 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  64.8 
 
 		 385 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  63.97 
 
 		 398 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  61.62 
 
 		 380 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  59.79 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  58.56 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  59.79 
 
 		 389 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  60.05 
 
 		 389 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  60.47 
 
 		 390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  60.37 
 
 		 388 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  58.74 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  56.92 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  60.65 
 
 		 400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  59.5 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  59.46 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  56.16 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  48.03 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  49.58 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  50.52 
 
 		 524 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  52.42 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  48.56 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  50.91 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  50.52 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  49.23 
 
 		 521 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  47.95 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  48.72 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  51.16 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  50.99 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  48.71 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  48.82 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  50.58 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  47.69 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  49.58 
 
 		 519 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  50.58 
 
 		 375 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  48.56 
 
 		 518 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  48.82 
 
 		 518 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  48.82 
 
 		 518 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  44.21 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  49.14 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  48.46 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  48.46 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  48.43 
 
 		 375 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  48.43 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  52.05 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  46.53 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  45.36 
 
 		 387 aa  364  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  45.62 
 
 		 374 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  47.67 
 
 		 366 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  45.62 
 
 		 385 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  45.6 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  41.78 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  43.67 
 
 		 388 aa  320  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  44.07 
 
 		 377 aa  303  6.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  47.67 
 
 		 311 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  40.17 
 
 		 380 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  46.78 
 
 		 281 aa  246  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  45.95 
 
 		 320 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  46.21 
 
 		 308 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  40.15 
 
 		 284 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  37.77 
 
 		 295 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  41 
 
 		 284 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 		 304 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  36.69 
 
 		 279 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  39.92 
 
 		 285 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  38.93 
 
 		 288 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 303 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  39.91 
 
 		 254 aa  181  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  35.98 
 
 		 304 aa  180  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  45.83 
 
 		 279 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  37.25 
 
 		 255 aa  179  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  37.41 
 
 		 294 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  37.99 
 
 		 284 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  38.13 
 
 		 292 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  35.47 
 
 		 279 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.47 
 
 		 279 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>