113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4345 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
325 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  72.64 
 
 
321 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  69.59 
 
 
323 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  69.59 
 
 
323 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  63.92 
 
 
323 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  77.14 
 
 
322 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  77.14 
 
 
322 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  76.79 
 
 
322 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  55.4 
 
 
343 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  50.18 
 
 
329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  46.71 
 
 
320 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  45.48 
 
 
314 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  42.81 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.43 
 
 
359 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.22 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  37.5 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.85 
 
 
342 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  35.53 
 
 
361 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  35.53 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  38.29 
 
 
341 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  38.29 
 
 
346 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  34.63 
 
 
363 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  35.63 
 
 
353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  38.29 
 
 
342 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  37.55 
 
 
319 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  32.47 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.91 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.09 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  37.1 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  33.86 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  35.81 
 
 
331 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  34.63 
 
 
354 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.61 
 
 
334 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  36.11 
 
 
331 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  32.99 
 
 
336 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  33.65 
 
 
356 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  27.41 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  30.21 
 
 
382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  33.78 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.22 
 
 
356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  30.75 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.28 
 
 
352 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  33.47 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  29.41 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  30.28 
 
 
336 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  32.36 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  30.77 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  28.27 
 
 
361 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  32.71 
 
 
368 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  28.01 
 
 
338 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  26.64 
 
 
337 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  30.74 
 
 
341 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35 
 
 
299 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  29.68 
 
 
342 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  27.36 
 
 
337 aa  99  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  28.36 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  27.3 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  27.3 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  27.3 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  26.98 
 
 
338 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  32.6 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  27.47 
 
 
897 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  32.3 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  28.79 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.66 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.44 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  28.98 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.59 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.03 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  34.18 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  31.71 
 
 
661 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  27.14 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  27.14 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  28.35 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  29.29 
 
 
314 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.51 
 
 
698 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  35.54 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  24.07 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.94 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  32.06 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  31 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.5 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  27.23 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  26.24 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  28.57 
 
 
421 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  29.38 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  30 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  32.62 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  27.66 
 
 
338 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  27.66 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  32.86 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  33.08 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  29.29 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  25.87 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  37.35 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  25.99 
 
 
742 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.36 
 
 
597 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  25.35 
 
 
614 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  37.5 
 
 
313 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>