More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4086 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  95.98 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  95.54 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  61.54 
 
 		 227 aa  251  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  33.49 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  34.31 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  34.21 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.07 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 254 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  34.36 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  35.2 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.77 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0223  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.41 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.41 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4903  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>