More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0814 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  85.51 
 
 		 69 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.94 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 72 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  46.15 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  46.67 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  46.67 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  40 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  38.89 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  37.5 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3034  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  34.33 
 
 		 245 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  39.34 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  38.46 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 475 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 201 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  41.18 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  38.33 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  28.44 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 333 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>