More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1003 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  88.79 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  88.79 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  88.79 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  88.79 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  88.79 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  87.85 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  87.85 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  87.85 
 
 		 107 aa  194  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  86.92 
 
 		 107 aa  191  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  85.05 
 
 		 107 aa  190  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  49.18 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.27 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 		 488 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 489 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 490 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 528 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  42.62 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  42.37 
 
 		 483 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 470 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  33 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 470 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  45.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  45.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 255 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  45.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  45.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 		 209 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  45.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  45 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.75 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  45.61 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 432 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2264  conjugal transfer protein TrbA  41.18 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000287063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  35.38 
 
 		 489 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  44.44 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 478 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  37.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>