194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6829 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  72.82 
 
 
493 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  62.4 
 
 
494 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  100 
 
 
492 aa  999    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  72.21 
 
 
493 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  72.21 
 
 
493 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  59.02 
 
 
490 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  59.73 
 
 
493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  61.35 
 
 
578 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  61.12 
 
 
494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  61.35 
 
 
494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  56.3 
 
 
532 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  59.03 
 
 
498 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  59.03 
 
 
498 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  58.82 
 
 
498 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  40.56 
 
 
465 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36.64 
 
 
447 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  38.29 
 
 
450 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  38.29 
 
 
450 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  37.64 
 
 
459 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  34.97 
 
 
457 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  36.42 
 
 
492 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  37.23 
 
 
454 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  37.03 
 
 
446 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  34.64 
 
 
456 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  36 
 
 
454 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  37.95 
 
 
439 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  37.28 
 
 
449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  35.25 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  36.4 
 
 
499 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  34.37 
 
 
452 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  33.79 
 
 
458 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  32.82 
 
 
456 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  33.63 
 
 
462 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  31.31 
 
 
459 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  33.04 
 
 
463 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  31.01 
 
 
487 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  33.92 
 
 
463 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  33.94 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  29.35 
 
 
464 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  28.95 
 
 
510 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  29.82 
 
 
469 aa  156  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  31.3 
 
 
445 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  30.77 
 
 
512 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 
492 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.93 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  31.92 
 
 
438 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  29.32 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  27.29 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.89 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  26.97 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  28.51 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  28.57 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  23.37 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  27.12 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.88 
 
 
492 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.45 
 
 
525 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  26.79 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  29.54 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.25 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  26 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.1 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.14 
 
 
592 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.28 
 
 
480 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  30.05 
 
 
543 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  28.76 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  27.16 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.45 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.58 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  31.4 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  23.25 
 
 
528 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  26.45 
 
 
349 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.45 
 
 
431 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.85 
 
 
469 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  26.4 
 
 
495 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  26.39 
 
 
365 aa  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  28.08 
 
 
521 aa  63.5  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  30.15 
 
 
387 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.74 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.65 
 
 
565 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  31.51 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.52 
 
 
439 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  55.22 
 
 
419 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.05 
 
 
495 aa  60.1  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  30.99 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  38.27 
 
 
557 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  37.93 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  26.58 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  32.39 
 
 
378 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  27.96 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.74 
 
 
491 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  27.96 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  23.8 
 
 
625 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  24.26 
 
 
466 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.2 
 
 
482 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  25.79 
 
 
433 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.24 
 
 
619 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  33.09 
 
 
575 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.65 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  22.65 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>