More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2803 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
387 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  65.13 
 
 
384 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  64.45 
 
 
388 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  63.68 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  62.94 
 
 
422 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  60.81 
 
 
384 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  62.67 
 
 
382 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  62.67 
 
 
424 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  60.71 
 
 
383 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  62.67 
 
 
382 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  61.33 
 
 
388 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  60.91 
 
 
386 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  60.41 
 
 
386 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  61.66 
 
 
385 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  61.39 
 
 
385 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  61.66 
 
 
385 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  52.19 
 
 
387 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  51.67 
 
 
387 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  72.17 
 
 
278 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  44.77 
 
 
383 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  44.53 
 
 
383 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.1 
 
 
383 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.1 
 
 
383 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  44.75 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.66 
 
 
381 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  42.37 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.85 
 
 
384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.85 
 
 
384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.55 
 
 
385 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.55 
 
 
385 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.04 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.61 
 
 
384 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.61 
 
 
384 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  42.17 
 
 
379 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.61 
 
 
384 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.36 
 
 
384 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.4 
 
 
383 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  42.2 
 
 
436 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  42.2 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  42.2 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  42.2 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  42.2 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.2 
 
 
436 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  42.2 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.13 
 
 
379 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.13 
 
 
379 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.13 
 
 
379 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  41.89 
 
 
379 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  41.89 
 
 
379 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.67 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  42.58 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  41.95 
 
 
386 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.08 
 
 
384 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  42.09 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.67 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  44.15 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  41.85 
 
 
381 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.2 
 
 
383 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  43.9 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  40.57 
 
 
394 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  38.39 
 
 
383 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  40.33 
 
 
394 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  41.05 
 
 
391 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  40.33 
 
 
394 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  42.04 
 
 
380 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  42.04 
 
 
380 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  39.37 
 
 
409 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  42.04 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  42.04 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  42.04 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  42.04 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  39.37 
 
 
409 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.37 
 
 
391 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  42.04 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.33 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  42.04 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  41.43 
 
 
389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  39.66 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  39.91 
 
 
394 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  40.34 
 
 
380 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  40 
 
 
375 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.48 
 
 
383 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  39.42 
 
 
383 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  38.7 
 
 
389 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  41.19 
 
 
389 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  39.77 
 
 
408 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  40.81 
 
 
363 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  41.99 
 
 
384 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  40.58 
 
 
384 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.42 
 
 
380 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  39.26 
 
 
375 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  39.75 
 
 
375 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  39.75 
 
 
375 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  40.7 
 
 
379 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  41.42 
 
 
380 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  40.7 
 
 
379 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  40.95 
 
 
379 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  40 
 
 
379 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  39.44 
 
 
390 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  39.44 
 
 
390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>