More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4309 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 289 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  94.64 
 
 		 288 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  95.36 
 
 		 292 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  95 
 
 		 292 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  95.83 
 
 		 321 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  95.83 
 
 		 321 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  46.01 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  41.8 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  38.69 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  45.49 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  41.87 
 
 		 281 aa  201  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  40.23 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  41.95 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  37.14 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  36.78 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  36.8 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  37.7 
 
 		 275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  38.33 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 275 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 275 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  34.59 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.65 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  34.66 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 274 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1010  MscS Mechanosensitive ion channel  43.67 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  33.47 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  33.2 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  36.8 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  36.29 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.48 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  32.2 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  34.77 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.82 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.82 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.82 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.82 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.82 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0222155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5651  hypothetical protein  34.07 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  37.34 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2492  MscS Mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1616  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.19083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2526  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2898  MscS Mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.41 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.47 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.47 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  34.47 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  33.87 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2662  hypothetical protein  35.41 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  32.25 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  33.47 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  34.82 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4037  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  34.82 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>