82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3144 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 263 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  98.48 
 
 		 263 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  92.78 
 
 		 263 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  92.02 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  92.02 
 
 		 263 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  90.87 
 
 		 263 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  91.57 
 
 		 263 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  81.95 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  81.95 
 
 		 267 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  82.33 
 
 		 267 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  81.95 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  81.95 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  81.95 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  81.95 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  80 
 
 		 252 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  73.81 
 
 		 267 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  73.02 
 
 		 267 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  57.94 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  56.25 
 
 		 285 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  60.53 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  56.04 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  53.4 
 
 		 334 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.03 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  46.88 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  40.53 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.39 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  40.09 
 
 		 241 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  36.41 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.22 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  34.78 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  36.96 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.38 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.21 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  37.11 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  35.14 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.6 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  36.79 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  35.47 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  35.14 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  32.06 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  32.06 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.3 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.62 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.61 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.89 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.62 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  32.79 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.06 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.41 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.44 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.44 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.92 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.88 
 
 		 214 aa  85.5  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  31.35 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.8 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.5 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.59 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.59 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  31.35 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  31.35 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.69 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  30.15 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.73 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  30.5 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.79 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.74 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.89 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.15 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  25.7 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  29.55 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  25.39 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  21.3 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  28.35 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.09 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.56 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  25.89 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 220 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  25.54 
 
 		 250 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>