More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0027 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  99.8 
 
 		 489 aa  954    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  78.98 
 
 		 475 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  100 
 
 		 489 aa  956    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  99.39 
 
 		 489 aa  949    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  78.86 
 
 		 475 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  78.98 
 
 		 475 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  99.8 
 
 		 489 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  78.98 
 
 		 475 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  53.71 
 
 		 499 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  51.17 
 
 		 493 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  48.62 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  30.09 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 477 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 477 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 487 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  31.69 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.45 
 
 		 476 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  29.1 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.75 
 
 		 446 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  28.73 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 460 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  27.16 
 
 		 445 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  26.83 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  26.83 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 443 aa  133  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  31.22 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  31.22 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  31.22 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  31.22 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  30.98 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 480 aa  130  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.19 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  31.22 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.19 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.19 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.19 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.19 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  28.2 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 423 aa  126  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.16 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  29.43 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.17 
 
 		 438 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.32 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.34 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  29.34 
 
 		 442 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 442 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.45 
 
 		 472 aa  113  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.97 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.02 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  26.12 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25.33 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  28.71 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  28.71 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  27.96 
 
 		 477 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 451 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.5 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  27.59 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  28.81 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>